Настройка перерасчета необходимых видов начислений

Вообще то это нигде не настраивается. Все учтено в модуле этого документа, какие виды расчета перерасчитывать, а какие нет. Нужно в пользовательском режиме разбираться, что там не так сделали. Вы напишите, какие суммы по данным видам расчета были в прошлом периоде (за который делаете перерасчет) у данного сотрудника и какие стали в текущем периоде. И что поменяли в самом документе Доплата на питание? Из-за чего сумма в журнале расчетов должна поменяться?

Почему возникла необходимость перерасчета, потому что в прошлом месяце ошибочно сделали сотруднику начисление командировки - документ Оплата по среднему заработку. Т.е. сотрудник недополучил: оклад, доплата на питание, надбавку за выслугу. Я сделала Сторнирование командировки в текущем месяце - в результате сумма командировочных с минусом и это верно, но по сути здесь должны также выйсти с минусом суммы по окладу, надбавки и питания, но они не выходят. Поэтому я сделала Начисление зарплаты в текущем месяце за прошлый период (способ Переначисление зарплаты...) и в журнале выводятся:
оклад -
оклад +
надбавка -
надбавка +
надбавка за секретность (фикс.суммой) -
надбавка за секретность (фикс.суммой) +

надбавка за секретность вообще не должна перерасчитываться, а вот доплаты на питание вообще нет - что странно.

Почему Вы счиаете. что Доплата на питание должна была пересчитаться?

Потому, что Доплата на питание у нас рассчитывается в зависимости от отработанного времени. И в прошлом периоде человек недополучил, т.к. была оформлена на него командировка, в которой он и не был.

Перерасчет начислением делает перерасчет введенных документом начисления прошлого периода, на сколько я помню. К тому же всех начислений что он вводил, то есть если начисление не изменилось, оно все равно будет присутствовать +`ом и -`сом
Скорее всего Доплата на питание введена другим документом самостоятельно введшим записи. У таких документов есть кнопка "Исправить" (если нужно исправить только одно начисление вводимое таким документом, то переначисление ЗП можно и не делать)

Вы удалили командировку в прошлом периоде и увеличили отработанное время? И теперь доплата не пересчитывается?

Базу саму надо смотреть, если она не типовая. Так вслепую никак.

В конфигураторе есть правила перерасчета. Нужно поменять у табеля, что когда он перерасчитывается. то на его основании. чтобы перерасчитывалось Доплата на питание.

Добавить правило перерасчета, если такого нет.

Спасибо большое за то, что не оставили меня наедине со своими мыслями. Скорее всего это дело в документе Табель - в конфигураторе в модуле документа процедуру по обработке проведения дописывать.