Расчет по страховым взносам ЗУП показывает минусы

У тебя же на картинке видно - категории застрахованного лица "играют". С МС на НР
Почему то пересчитались (сминусовались) с субъекта малого и среднего предпринимательства.

Вряд ли это кадровый перевод, это ты в наверно настройках поменял категорию с МСП на обычную. Причем может быть поменял задним числом.
Вот программа и заминусовала все, что касается МСП, и (по всей видимости) пересчитала на обычный тариф НР.

В общем, смотри, что там у тебя с тарифом МСП (историю изменений).
Ну и пересчитать взносы после того, если найдешь косяк с МСП.

А вообще для твоего релиза (ЗУП 3.1.27.90) выпущен патч - EF_80000252 "В организациях, применяющих льготный тариф исчисления страховых взносов для МСП (или аналогичные), в отчете Расчет по страховым взносам (РСВ) неверно заполняются показатели исчисленных взносов"
У тебя все патчи стоят?

Лучше бы конечно обновиться на крайний релиз..