1) Обработку необходимо подключить в справочник "Внешние обработки" как обработку по заполнению табличной части в документе "оприходование товаров".
2) Создать документ "Оприходование товаров", указать там склад и организацию.
3) Над табличной частью нажать "Заполнить->Заполнить по отрицательным остаткам".
Табличная часть заполнится по отрицательным остаткам на указанном складе.
03.10.11
Исправлена ошибка проставления статуса партии.
Создана форма обработки. Теперь можно не подключать к табличной части в качестве внешней обработки, документ можно выбрать в диалоговом окне. Необходимо учитывать что остатки проверяются на дату указанную в документе.