Сравнить 2 файла Эксель как "Сравнить файлы 1с"

WinMirge например. Им собственно и сравнивать.
Позволяет устранять различия путем принятия изменений или не принятия построчно и в ручном режиме. Есть горячие клавиши Альт+Стрелки для быстрого разбора поблочных/построчных различий. В конечном итоге получается необходимый текст.
В 1С такого функционала реально не хватает.

Из минусов лет 10 назад не было отдельной настройки разбора модулей кода с выделением по конструкциям языка.
Т.е. Например если есть "Процедура ИмяПроцедуры(", то сравнивать не просто текст, а с попыткой найти блок с такой же процедурой. Если таковой нет, то помечать как весь блок удаленный. Как сейчас не скажу.
Выход конечно же есть. Если изменений не сильно много, то это и не нужно и так всё нормально определяет. Если огромный общий модуль или как в 77 глобальный модуль на много десятков тысяч строк, то сравнивать отдельные большие куски. В общем, в несколько этапов.

Сейчас WinMirge много что сравнивать может.
На 1С тоже можно сравнение mxl нарисовать. Для 77, когда-то лет 15-ть использовал такую при автоматическом тестировании.

Ну либо я не нашел как сравнить Эксел/Опен файлы в WinMirge, либо это не поддерживается

(3) Бинарные файлы даже сравнивать можно. И картинки можно (не пробовал, но заявлено, на скринах ниже видно как это выглядит).

https://winmerge.org/screenshots/?lang=ru

Если вам необходимо сравнивать текстовые файлы (xml, json и т.д), то проще сразу это делать не в 1С.
Не обязательно winmerge, подобных средств много разных.