Расширение убивает структуру данных

Собственно в данной теме https://forum.infostart.ru/forum64/topic204501 я описал проблему с котрой столкнулся.

Сразу после написания поста я проанализировал что глобального делалось с базой, и на ум пришло лишь внедрение расширения с переносом в него всех доработок.

Путем нехитрых манипуляций было установлено, что ссылочная целостность не нарушается если в расширении менялись только формы (так было до переноса в него доработок), но как только мы добавляем свои объекты, все рушится.

Естественно новые объекты скорее всего не причем, а виной всему добавленные реквизиты к заимствованным объектам, ведь порушились только ссылки на объекты к которым добавлялись реквизиты.
Сразу отмечу что на этапе принятия изменений все проходит прекрасно.
Список ошибок при ТИ Ошибки

Кто сталкивался, кто что думает по данному вопросу? Просто неохота отказываться от расширения :)