Обособленные подразделения есть в версии КОРП, а в "Бухгалтерия предприятия, редакция 3.0 (3.0.96.35)" их быть не должно вовсе, т.к. это версия ПРОФ.
В тестовой базе БП КОРП создал обособленное подразделение - в карточке организации пункт "Поразделения" на месте, там без проблем создаются и добавляются любые подразделения внутри Обособленного подразделения.
Опишите подробнее, какую точно конфигурацию вы используете и ваши затруднения.