В Акт сверки с контрагентом попадает реализация от другого контрагента

(1) Как такое может быть - ошибки при ведении учета, работе задним числом, или программном изменении реквизитов.
Например, кто-то напрямую перепривязал подчиненность договора от одного контрагента к другому.
Или криво перепровели документы.

Как с этим бороться - следить за порядком в базе, восстанавливать последовательность (при возможности), сократить работу задним числом.

(3) на что именно обратить внимание - на то, как и какие документы его двигают, и где ошибка.

PS раз в месяц бэкапы - рисковый товарищ, однако.
Маклауд :)

(2) А на что именно обратить внимание? есть копия базы месячной давности, в ней все нормально. В оригинальной лишние проводки появились после запуска обработки Проведение документов по регистрам НДС. Причем в копии запускал обработку- нет лишних проводок!

(6), Спасибо, помогло