Проведение сдельных нарядов

(1) Такой эффект может быть по следующей причине.

Если посмотреть алгоритм проведения, то можно увидеть такой факт.
Перед проведением каждого документа конфигурация проверяет наличие разрешений у конкретного пользователя.

Когда у пользователя роль ПолныеПрава, то не выполняется ряд процедур и запросов.

Следовательно скорость проведения документов у простого пользователя и у пользователя с полными правами изначально разная.

И ещё чем больше у пользователя ролей, тем дольше вычисляется что ему можно а что нельзя.

Решение простое.
Надо создать одну роль для каждого типа пользователей.
К примеру создал роль НашМенеджер и прописал туда всё что он может делать. И всё.