Инвентаризация товара

Вы это как поняли? Результат с отчетами сравнили?

При заполнении по регл учету, насколько я помню, происходит в 2 этапа. Вначале берутся данные из регистра "товары на складах" (а то мало ли, вдруг у вас настройки регл учета не подразумевают детализации по складам, характеристике и прочему). Далее количественные показатели дополняются данными из регистра "учет затрат (регл)" для определения стоимостной оценки. Все вышеперечисленное относится к РАУЗу (заполнение при партионном учете честно детально рассматривать не приходилось).

Все верно, только документ "Инвентаризация товаров на складах" при заполнении по остаткам не учитывает особенность получения данных виртуальных таблиц вида "остатки" регистров накопления (конкретно в этом случае РН.ТоварыНаСкладах.Остатки), т.е. когда, к примеру, остатки берутся на время 23:59:59 (время самого документа инвентаризации), то не учитываются движения документов с временем 23:59:59. А отчеты эту особенность учитывают, поэтому данные документа могут отличаться от данных складских отчетов.
В 1С сказали что пожелание зарегистрировано, когда-нибудь допилят, но пока не планируют.

Разобрался.
При заполнении по регл. учету, количество берется по упр. учету. БАГ разработчиков.