Оприходование материалов

2 варианта:
1 это приходовать на склад мешок муки, а после документом комплектация номенклатуры сделать из мешка муки 50 кг муки и 1 мешок, а после продать мешок а муку отдать в производство.
2 приходовать сразу на склад 50 кг муки и 1 мешок, хотя наверное это будет протеворечить приходной накладной

используйте возвратную тару!

И как возвратную тару потом продать? я Имею ввиду как потом это выгрузится в бухгалтерию, у вас будет лишний оборот по счетам учета возвратной тары, а оно надо?

МПЗ являлся составным и был разделен на материалы и товары

Для этого, во-первых, нужно создать новый документ Комплектация номенклатур. Далее в документе необходимо выбрать операцию Разукомплектация. После этого в шапке документа указывается разбираемая номенклатура, место ее нахождения (склад), количество и счет на котором она учитывается. Затем в таблице Комплектующие нужно указать соответствующие комплектующие позиции. Их можно заполнить:

по фактическим данным подбором (Подбор);
согласно спецификации, нажав на кнопку Заполнить, если в справочнике Номенклатура указана спецификация соответствующего элемента номенклатуры с наименованием ее составляющих и их количества.
После разукомплектации для каждой комплектующей номенклатуры указывается бухгалтерский и налоговый счет учета. Склад остается тем же. В таблице комплектаций отражается доля стоимости каждой полученной номенклатуры. После указания всех этих данных документ можно проводить.