Некорректный расчет торговой наценки при учете в розничных ценах

У нас в БП 2.0 ведется учет на розничном складе в продажных ценах, при расчете торговой наценки возникла проблема при начислении торговой наценки в случае, когда товар был продан со скидкой:
Чтобы показать проблему, распишу движения по документам и наиболее значимые проводки из этих доков:
1. Документом Поступление товаров и услуг приходуем 10 столов на розничный склад (себестоимость 1180, в т.ч. НДС - 180 руб; розничные цены - 3000 руб)

41.11 / 60.01 10.000 (себестоимость без НДС)
19.03 / 60.01 1.800 (НДС)
41.11 / 42.01 20.000 (Наценка)

2. Документом "Отчет о розничных продажах" (или РТиУ) фиксируем факт продажи одного стола за 2000 руб. (т.е. стол был продан со скидкой в 1000 руб от розничной цены)

90.02.1 / 41.11 3.000 (реализовано в розничных ценах)
41.11 / 42.01 -1.000 (переоценка, минусуем наценку)
90.02.1 / 41.11 -1.000
50.01 / 90.01.1 2000 (продажи)
90.03 / 68.02 305,08 (налоги)

3. Закрываем месяц и делаем Расчет торговой наценки по проданным товарам. При этом программа в качестве реализованного торгового наложения выдает цифру 1310,34
Но ведь это неверно. Если посмотреть на проводки выше, то мы видим, что товар, проданный за 2000 руб, "состоит" из 1000 руб себестоимости и 1000 рублей реализованной наценки...
Смотрел уже дальше.. за счет некорректного расчета наценки неправильно считается налог на прибыль (сумма налога завышается).. Что порекомендуете сделать? На всякий случай - отказаться от ведения учета в продажных ценах не получиться, т.к. на самом деле все документы в БП выгружаются из УТ 10.3, где система давно отлажена и работает именно в продажных ценах по нескольким магазинам (розничным складам).