Чётко сходу не отвечу. И так уже аналогичный вопрос "висит"..., только про УПП (Управление производственным предприятием, тут).
По роду и направлению деятельности мне достаточно редко приходится сталкиваться в данной конфигурацией. Пока, по крайней мере.
В обеих программах есть особенности, направленные на расчет себестоимости (РАУЗ и партионный учет) продукции и товаров, работ, услуг.
РАУЗ и Парт.учет - это такие встроенные механизмы. Они вроде не должны одновременно существовать. Но... странности случаются (смотрите цитаты ниже).
В Комплексной не все обработки видны в Бухгалтерском и даже в Полном интерфейсе.
Нужно переключаться на "Заведующий учетом". Там есть обработки для проведения отложенных регламентных операций. В том числе и по налоговому учету.
Программы рядом нет. Постараюсь завтра найти возможность "влезть " в пр-му. Может, добавлю что-нибудь, если др.специалисты до этого не расскажут о иных важных нюансах "Комплексной автоматизации 8".
--
В этой теме http://www.buhonline.ru/forum/index?g=posts&t=45908&p=2 пр-ст из Н.Новгорода писал про такие нюансы, что (далее цитирую) "перед формированием в КА 8 при базе Доходы-Расходы НЕОБХОДИМО запустить обработку Проведение по партиям несмотря на то, что включен механизм РАУЗ (1С любит такие вещи...), а затем запустить обработку проведения по регистрам налогового учета УСН. Вызываются обе штуки из интерфейса Заведующий учетом - Регламентные операции."
Ищите именно обработку "Восстановление последовательности НУ УСН". Потом пробуйте сформировать.