Сначала общепроизводственные списывают на себестоимость (109.61) пропорционально базе распределения(задается в учетной политике) соответствующим документом - Закрытие производственных счетов. Затем со 109.61 в дебет 401.10 документом Списание затрат по услугам (работам), чтобы уменьшить налогооблагаемую базу для прибыли.
Если списывать на 401.20, то и весь этот 109 счет ни к чему, нечего его использовать вовсе.
если затраты осуществляются за счет собственных средств (КФО 2), то на 401.10, если за счет субсидий (КФО 4), то на 401.20 (КОСГУ берется из кредита сч 109.ХХ)
абзац 5 п.152 инструкции для бюджетных учреждений, утв. Проказом 174н:
отнесение себестоимости выполненных бюджетным учреждением работ, оказанных услуг, на уменьшение финансового результата бюджетного учреждения от оказания платных услуг (работ) отражается на основании Справки (ф. 0504833) по дебету счета 240110130 «Доходы от оказания платных услуг» и кредиту соответствующих счетов аналитического учета счета 210960200 «Себестоимость готовой продукции, работ, услуг» (210960211 – 210960213, 210960221 – 210960226, 210960271, 210960272, 210960290)