Книга доходов и расходов УСН раздел 4 "Уменьшение налога" попадают документы "Списание с расчетного счёта"

Что значит убрать? Программа на основе ваших документов делает то, что предписано законом. Смотрите документы списания денежных средств. Вероятно, вы там что-то неправильно указали.

НК РФ, Статья 346.21. Порядок исчисления и уплаты налога:
3.1. Налогоплательщики, выбравшие в качестве объекта налогообложения доходы, уменьшают сумму налога (авансовых платежей по налогу), исчисленную за налоговый (отчетный) период, на сумму:
1) страховых взносов на обязательное пенсионное страхование, обязательное социальное страхование на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством, обязательное медицинское страхование, обязательное социальное страхование от несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний, уплаченных (в пределах исчисленных сумм) в данном налоговом (отчетном) периоде в соответствии с законодательством Российской Федерации;

УСН доходы, в книгу доходов и расходов четвертый раздел, сумма по страховым взносам переноситься автоматически, по каждой платежке в отдельности, как настроить отчет чтобы раздел заполнялся по периодам, одной суммой? (т.е 1 кв. 2 кв и т.д.)

Вопрос закрываю, это ответ техподдержки.