Пропадают проводки при выгрузке данных из другой конфигруации

Здравствуйте! Который день бьюсь с проблемой. Пользуемся программами: Альфа-Авто: Автосалон+Автосервис+Автозапчасти Проф, редакция 5 и 1С Бухгалтерия Предприятия 2.0.
В учетной политике бухгалтерии указано использование ОСН + ЕНВД для розничной торговли.
При выгрузке из Альфа-Авто документов, среди которых есть документы перемещения с оптового склада на розничный, неправильно формируются проводки при выше изложенном перемещении, т.е., проводка ДТ 41.02 КТ 41.01.
Если же мы помечаем все документы на удаление и пробуем добавить напрямую в 1С Бухгалтерия предприятия 2.0 документы поступления, перемещения и реализации, то все делается правильно, т.е. при перемещении с оптового склада на розничный должны быть такие проводки: (1) Дт 41.02 Кт 41.01
(2) Дт 19.03 Кт 68.02
(3) Дт 44.01 Кт 19.03.
Итог, как только происходит выгрузка ... проводки (2) и (3) таинственным образом исчезают ... подскажите, что это может быть и как решить эту проблему, если кто сталкивался с этим или знает как выйти и положения.
Спасибо.