Проблема с взаиморасчетами с сотрудниками

Добрый день.
У нового клиента стоит 1С 8.3 (версия 8.3.5.1383), обновили Бухгалтерию 3.0. до 3.0.39.65.
Пару месяцев назад начались проблемы в ведомостях выплаты зарплаты - почему то вдруг суммы к выплате стали показываться больше, чем начислено в этом месяце, и рядом пишет "в том числе за март 2015, февраль 2015" и т.д. Т.е. как буд-то считает, что не платили зарплаты. Это произошло, по словам бухгалтера, после какого-то очередного обновления. Проблема во взаиморасчетах с сотрудниками? Или в регистре зарплаты за месяц? И какие можно посоветовать советы по лечению?