Расходятся суммы документа

Расшифровка с детализацией до регистратора что показывает?
А так, вообще, в общем случае, надо тестирование и исправление делать... (предварительно сделав копию БД ;) )

Тогр-29, как мне кажется, при формировании берёт цену и документа "Переоценка товаров в рознице", документ "Реализация товаров и услуг" берёт ту цену, которая прописана в договоре с конкретным контрагентом. Или вы, вообще можете, в принципе, поставить ручками такую цену, какая вам захочеться. И они, вполне возможно, могут различаться.
И торг-29 этож для розницы, как мне кажеться.
На сколько расходятся? на копейки? на рубли?
И ничего истравлять и тестировать не надо.

Все верно, в торг 29 передается не сумма документа, в сумма, которая передается в регистр "Товары в рознице". Эту сумму можно посмотреть в Движениях документа по регистрам

В торг 29 сумма без скидок

Суммы разнятся из-за переоценки товара, т.е. пришёл товар с новой ценой, а старый такой же товар остался по старой цене.