(1) k, при распределении уплаченных сумм уволенные сотрудники ничем не отличаются от продолжающих работать. И если на конец квартала у вас есть задолженность( обычно за последний месяц), то вся эта сумма "равномерно", т.е. пропорционально начислениям, распределяется по всем сотрудникам. Когда в следующем квартале вы погашаете эту задолженность, долги "закрываются".
(4) Svetlana_E, как закрывать уплату по уволенным, договорникам, превысившим предел базы - зависит от конкретного отделения ПФР. Есть отделения, которые требуют уплату по указанным сотрудникам закрывать в первую очередь, а остаток распределять пропорционально между остальными. Иначе, не принимают отчет. И есть обработки, которые позволяют это делать, например, вот эта: http://infostart.ru/public/73085/.