Не работает свод по заработной плате

Так просто и не скажешь это надо анализировать.

Как вариант сформировать заново выплаты.

А вообще это скорее связано с НДФЛ (не по тем статьям финансирования взялся).

Какими документами делали исправление?
Если корректировали НФДЛ то нужно вносить изменения в 2 регистра НДФЛ к зачету и НДФЛ расчеты с бюджетом
Если же начисления Взаиморасчеты с сотрудниками и зарплата за месяц организаций

"Почему свод показывает непонятное сальдо за работниками, учреждением?" - как формируете, как показывает. На начало года, месяца. У нас было такое, до начало отпуска смотрел, сейчас точно не вспомню, у работника точно также по своду одно, в анализе другое. Конкретно как показывает?

Если делался перенос из ЗиК, то такое возможно. Приходится пересчитать итоги, и тогда все выравнивается. А так обычно я анализирую расчетную ведомость в произвольной форме и делаю отбор по каждому источнику и заставляю расчетчиков выверять начисления и удержания. Обычно при распределении начислений по источникам в документах, где производится расчет по средней они ошибаются, ручками правят, короче хулиганят, причем зачастую уже после того как выплату сформируют. Затем пересчитывают НДФЛ, и тут-то и все сальдо и плывет. Заставляю удалять все доки по выплате и перезаполнять. После этого все становиться красивым.

Свод показывает правильно, просто в разрезе статей финансирования.