Списание остатков отпусков

Да, в первом сообщении всё верно ответили - если Вы уверены, что на определенную дату у Вас есть все кадровые приказы и каждому из них есть полное (по датам отпусков) соответствие в виде расчетного документа - то в таком случае просто меняете настройку и работаете дальше. Отпуска будут корректно списываться.

Моё Imho, но опыт подсказывает, что расчетный документ есть всегда. Кто бы чтобы ни говорил, а кадровики частенько "забывают" заводить свои документы. Расчетчики в этом отношении (если это не один и тот же человек) более практичны. Т.к. за отсутствие отпускных денег сотрудники спросят именно с них, а не с кадровиков.

Мне кажется, но в ЗУП 2.5 есть 2 крайности, исходя из которых нужно выбирать тот или иной способ - это возврат на работу из отпуска (Ваш случай) и болезнь человека в отпуске.

Если много возвратов из отпусков, то, действительно, проще использовать кадровые документы. При этом приходится исправлять расчетные документы отпусков, т.к. там нет полной аналогии кадровому возврату - это 1 крайность, Ваш случай.
Но есть и другая крайность - расчетными документами удобнее оперировать, если вдруг сотрудник, находясь в отпуске, внезапно заболел. В таком случае приходится корректировать уже кадровый документ отпуска. Да, таких случаев, в большинстве фирм, единицы, но они есть. Скажите Вашим кадровикам, чтобы они не забывали про эту особенность.