Минусы в отчете Себестоимость товаров организаций

(1) Добрый день!
Возможно сама по себе учетная ошибка (стандартная проблема - продали дешевле, чем купили).
Проверьте закрыт ли месяц? Может не все документы/движения сформировали. Дополнительно попробуйте изменить период, иногда 1С за маленький период не захватывает все движения по номенклатуры и показывает не верное значение. Рекомендую расширить до 1 месяца.

(3) Тогда попробуйте сформировать универсальный отчет по регистру накоплений "Себестоимость товаров", в структуру отчета добавить больше аналитики, например, вид запасов, НДС, ГТД (если используете), партию/серию. Развернуть отчет до регистра, чтобы посмотреть почему себестоимость идет в минус. Может быть такое, что аналитика прихода и расхода (материала, если делаете производство) расходится и соответственно данные между собой не сходятся.