часть товара приходит на склад раньше документов

Добрый день, в компании такая ситуация, что часть товара приходит на склад раньше документов, а часть наоборот – сначала появляется документ в ЭДО и только потом приходит товар. Начальник склада по-разному пробовал отражать эти поступления, но всегда получается каша – остатки по учету не соответствуют действительности. Каким образом лучше реализовать такой момент? Конфигурация УТ 11.5.