Специализированная конфигурация на поддержке, все объекты помечены как "редактируется с сохранением поддержки".
Вижу, что при установке обновления конфигурации код модулей объединяется трехсторонним объединением сторонней программой (в качестве базы выступает старая конфигурация поставщика), что правильно и хорошо.
А в каком режиме объединяются метаданные? Я опасаюсь, что если этот режим -- "Взять из файла" (как при "сравнить, объединить с конфигурацией из файла" в конфигураторе по умолчанию) -- то я потеряю все свои изменения. Насколько мне известно, сама платформа 1С трехстороннее объединение не умеет ни в каком виде и вообще боится его как огня.