Почему измененные объекты не помечены для объединения?

Обновляю не типовую конфигурацию. В окне сравнения основной конфигурации с новой конфигурацией поставщика галки для объединения поставлены не для всех различающихся объектов. Например, типовой(не доработанный) общий модуль в новом релизе изменен, но по умолчанию признак на объединение данного модуля из нового релиза не установлен.
Почему? Стоит ли вручную ставить данный признак или оставить как есть?