Для оценки рентабельности относительно какого-то вида цен, надо указать этот вид цены в настройках и установить галочку "Себестоимость в ценах номенклатуры". Без этой галочки отчет работает как стандартный отчет из конфигурации по валовой прибыли.
Разработано и протестировано на конфигурации Управление Торговлей 11.4.6.