Обмен между идентичными базами ЗИК ГУ 3.1 (при создании правил обмена не переносятся регистры)

Доброго времени суток.
Есть задача - слияние двух типовых баз ЗИК ГУ 3.1.5.442 в одну.
Пользуясь Конвертаций данных 2.1 составляю правила обмена.
Поскольку базы идентичные - крайне желательно не перепроводить документы, для чего при выгрузке описания структуры метаданных галочки о необходимости выгрузки всех регистров выставлю.
Правила обмена создаются стандартно - лишь кое где поиск по внутреннему идентификатору отключаю, дабы не двоить начисления - удержания и физлиц.
Документы больничных, отпусков, вычетов НДФЛ и тд загружаются, но записей регистров по ним все равно нет. Приходится перепроводить.
Конвертацию пользую недавно - возможно что-то делаю не так.
Подскажите где ошибка.