Отслеживание ошибок при записи и проведении данных

делать отложенное проведение.
например, включать обработку, которой после загрузки передавать список загруженных документов и открывать ее форму, а потом по кнопке уже проводить (при этом все документы уже записаны в базе будут

Мне как раз надо, что бы документы не записывались в базу.
Силами конвертации это как-то можно сделать?

ну так передавайте вместе с документами еще и признак найден он или создан, и если документ создан, но не проводится - удаляйте.

конвертацией проконтролировать кроме как через такую обработку не получится, потому что документы будут записываться (и проводиться, соответственно) только после отрабатывания обработчика ПослеЗагрузки конвертации.
Обработка для того и нужна, чтобы на ней нажать кнопку, потому что кнопка нажмется после того, как обработка загрузки отпустит интерфейс, выполнив свое дело

можете еще попробовать в обработчике ПослеЗагрузки документа выставить Отказ = Истина, но при этом сам объект передать в обработку. тогда конвертация не должна его записать, а у вас будет созданный и заполненный объект документа.